Postdoc genetica en biochemie onderliggend aan cellulaire stress bij long COVID

Intro

Wil jij samen met ons het verschil maken; zoeken naar de oorzaak van long-COVID? Long-COVID treft vele tienduizenden mensen in Nederland alleen al, die daardoor niet meer het leven kunnen leiden wat ze willen.

Wat ga je doen?

In dit project zullen wij opgeslagen materialen van long-COVID patiënten gebruiken, met name plasma, bloedcellen (PBMC) en hersenweefsel.

• Met PBMC proberen wij de katalytische route van IDO2 verder in kaart te brengen, met behulp van stabiele isotoopsubstraten en UPLC tandem-massaspectrometrie. Na validatie van de analytische procedures zullen we een grote set plasmamonsters screenen die zijn gericht op het identificeren van een diagnostische marker voor long-COVID en mogelijk andere post-acute infectieuze syndromen.
• Tegelijkertijd willen we verduidelijken waarom sommige cellen wel IDO2 en aangrenzende cellen geen IDO2 tot expressie brengen, door vergelijkende transcriptomics en metabolomics. Dit zal worden gedaan in zowel hersenweefsel door specifieke gebieden te scheiden met behulp van laserdissectie, als in bloedcellen.
• Bovendien zullen we proberen vast te stellen waarom sommige individuen IDO2 tot expressie brengen en long-COVID ontwikkelen, en anderen niet. Dit doen we met een vergelijkbare benadering en in combinatie met het analyseren van genetische polymorfismen. Wij verwachten ‘precision cut brain sections’ te gebruiken om de bevindingen te evalueren.

Wat neem je mee?

Jij bent een zeer gemotiveerde postdoc en:

• hebt een PhD afgerond in biochemie of genetica;
• hebt relevante laboratoriumexpertise (genetische polymorfismen, metabolomics, transcriptomics, pathologie en mogelijk ervaring met laserdissectie);
• bent een onafhankelijk onderzoeker;
• kunt goed communiceren met verscheidene basale onderzoekers, clinici en patiënt vertegenwoordigers;
• kunt goed bevindingen en gevolgen communiceren naar zowel professionals als een breder publiek.

Wat bieden we jou?

• Een vliegende start van jouw carrière in het onderzoekswerk.
• Alle ruimte voor jouw drive om de zorg van morgen vorm te geven.
• Werken aan grootschalig én eigen onderzoek, met gemotiveerde collega’s uit alle hoeken van de wereld.
• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV.
• Een contract voor twee jaar aangezien het een tweejarig project is. Er zal een proeftijd van twee maanden zijn.
• Inschaling in salarisschaal 10: € 3.493 tot € 5.504 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring) en een eindejaarsuitkering van 8,3%. Bereken hier jouw netto salaris.
• Vakantie-uren: 186,4 uur per jaar bij een fulltime dienstverband en een mogelijkheid om uren bij te sparen.
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen.
• Bij 7 km of meer (enkele reis) 100% OV-vergoeding en bij eigen vervoer €0,18 per km tot maximaal 40 km enkele reis.
• Kom je liever lopend of op de fiets? Maak gebruik van onze goede fietsregeling. Je ontvangt een vergoeding à €0,18 per km.

Bekijk deze video met meer informatie over de indiensttreding bij Amsterdam UMC Research BV.

Waar ga je werken?

Amsterdam UMC Research BV ondersteunt wetenschappelijk onderzoek zonder winstoogmerk. Hiermee voorzien we onderzoekers in alles wat ze nodig hebben om te kunnen excelleren. Zo bieden onze principal investigators (PI's) en projectleiders begeleiding op het gebied van projectbeheer, finance en human resources. Bij medisch-wetenschappelijke onderzoeksprojecten wordt daarnaast ook ondersteuning op juridisch vlak geboden.

Bekijk de video voor meer informatie.

Je wordt aangesteld door Amsterdam UMC Research BV en werkt binnen de onderzoeksgroep Pulmonologie van de afdeling Experimentele Immunologie (EXIM). Binnen deze afdeling van ongeveer 120 onderzoekers bundelen verschillende onderzoeksgroepen die verbonden zijn aan verschillende orgaangerelateerde ziekten hun expertise, delen ze technologie en zetten ze zich in voor translationele studies, d.w.z. proberen ze zo dicht mogelijk bij de patiënt te blijven. Tegelijkertijd zal de kandidaat samenwerken met wetenschappers van verschillende andere afdelingen zoals Interne Geneeskunde, Pathologie, Biobank, Bioinformatica/Centrum voor Experimentele en Moleculaire Geneeskunde en andere, en zal de kandidaat ook nauwe contacten onderhouden met centra in de VS en Europa.

Wat ga je onderzoeken?

Als postdoc ga je onderzoek doen naar long-COVID. Een eerdere studie liet de expressie en activiteit van het enzym IDO2 in bloed- en hersenweefsel van patiënten met long-COVID zien. Bekijk onze studie over post-acute gevolgen van SARS COV2-infectie hier: PMID 37506544. De resulterende kynurenine producten zijn onderliggend aan cellulaire metabole stress zoals wordt weerspiegeld door autofagie en mitochondriaal dysfunctioneren. Dit geeft een verklaring voor de langdurige expressie van IDO2 bij long-COVID patiënten. Anderen hebben aangetoond dat de kynurenine metabolieten correleren met cognitieve symptomen, post-inspannings malaise en ontsteking.

Een beter begrip van de regulatie van IDO2-expressie en activiteit kan leiden tot de identificatie van diagnostische markers voor long-COVID. Dit kan verklaren waarom een ??SARS COV2-infectie alleen bij sommige individuen tot long-COVID leidt.

Gebaseerd op wat wij nu weten, zullen we IDO2-activiteit en specifieke genetische factoren voor IDO2-expressie in long-COVID verder analyseren. We hebben aanwijzingen dat dit onderzoek ook relevant is voor kinderen met long-COVID en patiënten met ME/CVS.

De eerste ronde sollicitatiegesprekken staat gepland op 22 november. Wij vragen je om hier alvast rekening mee te houden. De tweede gespreksronde volgt in principe 29 november.

Heb je nog vragen? Voor inhoudelijke informatie over deze vacature kun je terecht bij Rene Lutter, principal investigator via r.lutter@amsterdamumc.nl.  

Voor meer informatie over de sollicitatieprocedure kun je terecht bij Rhiannon Sandfort, Recruitment adviseur, via r.e.sandfort@amsterdamumc.nl. 

Een referentiecheck en screening kunnen onderdeel zijn van de procedure. Kom je bij ons in dienst, dan vragen we voor een aantal functiegroepen standaard een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag). Lees hier wat dit inhoudt en of het voor jouw functie van toepassing is.

Interne kandidaten krijgen, bij gelijke geschiktheid, voorrang op externe kandidaten.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.